PCR法支原體檢測試劑盒介紹的太全面了,歡迎圍觀!
儲存條件
該產品在常溫下運輸,收到產品后,請立即放-20 ℃冰箱低溫保存。該條件下,至少2年內有效。
產品用途
《PCR法支原體檢測試劑盒》可用于檢測一切可能含支原體的樣品,比如:(1)體外細胞培養的上清;(2)血清;(3)各種體液,如唾液、尿液、鼻腔分泌物等;(4)別的液體樣品。本產品僅供研究使用。
產品簡介
哺乳動物細胞的培養,支原體(Mycoplasma)污染是個世界性的問題。支原體污染幾乎可以改變細胞的所有參數,導致實驗結果的不準確、甚至*錯誤。從2013年開始,《Nature》期刊已正式要求投稿的文章,如涉及細胞培養都要進行支原體檢測。相信會有越來越多的高水平期刊將做出同樣的支原體檢測要求。
培養法是相對可靠的支原體檢測技術,但是該方法非常耗時的,需要數周,不適合作為細胞培養液中支原體污染的快速檢測。此外,通過固體培養法無法檢測污染細胞的一種zui常見的支原體,即豬鼻支原體(M.Hyorhinis)。這是因為豬鼻支原體無法在支原體固體培養基上形成可見的菌落。而豬鼻支原體約占所有支原體污染的20-50%。
有的實驗室使用熒光染色法檢測支原體,但是該方法靈敏度太低,當檢測成陽性時,細胞經常已經嚴重污染。
目前,細胞培養液中支原體污染的檢測通常使用的是PCR法。但是PCR法也有明顯的缺點:(1)整個過程大約需要3個小時;(2)由于細胞培養數天后,培養液中經常含有嚴重抑制PCR擴增的代謝物,所以樣品的前處理一般是PCR法*的環節;(3)PCR法的靈敏度有限,通常需要將培養液離心濃縮或者抽提DNA后再檢測;(4)PCR產物的電泳,需要用到EB等潛在的致癌物質;(5)需要用到PCR儀、電泳槽、凝膠成像儀、離心機等儀器。
PCR法支原體檢測試劑盒介紹的太全面了,歡迎圍觀!
試劑盒組成
檢測過程:
待測樣品的準備
為了準確判斷細胞是否有支原體的污染,待測的細胞培養液樣品來源于至少培養3天且匯合度在70-90%左右的細胞培養液上清(貼壁細胞)。懸浮培養的細胞也需要在換液傳代后,至少讓細胞生長3天再取培養液進行檢測。取150 μL上述待測樣品,在普通臺式離心機上1200 rpm (大約150-200 g)離心5 min,取離心后的上清100 μL用于支原體檢測,丟棄下層剩余的50 μL(含細胞沉淀)。收集并已經離心去除細胞的待測樣品如果不立即檢測,請放于-20℃或-80℃冰箱保存,不得放于室溫或4℃冰箱。樣品在-20℃至少可以保存一個月,在-80℃基本可以保存。
注意:本步驟的低速離心是為了去除哺乳動物細胞,以排除其不必要的干擾。所以離心力要嚴格控制在150-200 g,該離心力下,哺乳動物細胞將被沉淀下來而支原體不會。如果錯誤使用更高的離心力將可能導致支原體也被離心下來,從而導致假陰性。
PCR體系的配制
請按下表(表1)進行PCR體系(總體積25 μL)的配制:
表1.PCR擴增體系的配制
| Negative Control | Positive Control | Sample |
去離子水 | 17.5 μL | 15.5 μL | 15.5 μL |
10×Taq DNA 聚合酶緩沖液(含Mg2+) | 2.5 μL | 2.5 μL | 2.5 μL |
2.5 mM dNTP | 2.5 μL | 2.5 μL | 2.5 μL |
5 Units/μL Taq DNA 聚合酶 | 0.5 μL | 0.5 μL | 0.5 μL |
支原體引物和內參 | 2 μL | 2 μL | 2 μL |
陽性支原體DNA或待測樣品 | - | 2 μL | 2 μL |
結果判斷
PCR擴增的結果有可能出現以下幾種情況(表2):
表2. PCR擴增的可能結果
| 電泳結果 | 電泳結果 | 電泳結果 | 電泳結果 | 電泳結果 | 電泳結果 |
586 bp內參條帶 | ++ | - | + | ++ | ++ | - |
270 bp左右條帶 | - | ++++ | +++ | ++ | + | - |
結果圖示(見圖1) | 泳道1 | 泳道2 | 泳道3 | 泳道4 | 泳道5 | 泳道6 |
支原體污染判斷 | 陰性 | 極重度污染 | 重度污染 | 中度污染 | 輕度污染 | PCR被抑制 |
注:“-”代表沒有條帶;“+”代表有條帶;“+”號越多代表條帶越強。
圖1. 支原體PCR擴增結果。586 bp條帶為內參條帶,270 bp左右的條帶為支原體特異條帶(各支原體的條帶大小會略有不同,總體在260-280 bp)。隨著支原體DNA模板的增加,270 bp左右的條帶會逐漸增強而586 bp的內參條帶會逐漸減弱,甚至消失。泳道1:陰性對照或者沒有支原體污染的樣品;泳道2:極重度支原體污染樣品;泳道3:重度污染樣品;泳道4:中度污染樣品;泳道5:輕度污染樣品;泳道6:PCR的擴增被細胞的代謝產物抑制,導致擴增失敗。M:DNA marker.
注意事項
每次檢測都應該設有陰性對照,作用有:
(1)由于有效的PCR擴增,陰性對照也會有一條586 bp的內參條帶,這樣可以保證本試劑盒含有的支原體引物和內參以及自己準備的Taq DNA 聚合酶,dNTP等試劑沒有問題;
(2)只有當陰性對照的結果沒有出現270 bp左右的支原體特異條帶時,別的樣品的結果才是可信的。
如果586 bp條帶和270 bp左右的條帶都沒有出現(如圖1,泳道6),在排除PCR試劑的問題后(即陰性對照可以正常擴增),說明該樣品含有抑制PCR擴增的代謝產物。有關PCR的擴增會被細胞的代謝產物抑制的問題,Sigma公司的LookOut Mycoplasma PCR Detection Kit(貨號MP0035)的PCR法支原體檢測試劑盒說明書中也特別提到了這點,說明這是一個PCR法支原體檢測中經常遇到的問題,其強烈建議用試劑盒進行DNA提取后再進行鑒定。這也是PCR法支原體檢測的致命弱點。
為了克服該問題,以下問題必須注意:
(1)您購買的PCR法支原體檢測試劑盒,其擴增產物中必須含有內參(Internal Contol)條帶作為對照【本試劑盒的586 bp條帶就是內參條帶】。否則,如果沒有內參作為對照,即使樣品擴增后沒有支原體特異條帶,你也無法確定是因為樣品確實沒有支原體還是因為PCR被細胞的代謝產物抑制導致的假陰性。
(2)如果出現PCR的擴增被細胞的代謝產物抑制時,請使用血液基因組DNA抽提試劑盒,抽提支原體DNA后再進行PCR鑒定。
(3)同時使用本公司生物試劑的《一步法恒溫支原體檢測試劑盒》進行檢測,經嚴格測試,該試劑盒的擴增不會被細胞的代謝產物抑制。
本試劑盒與Sigma公司的LookOut Mycoplasma PCR Detection Kit(貨號MP0035)的設計原理一樣,可以替代后者用于各類支原體的檢測。
根據支原體DNA的序列,本試劑盒可以識別所有100多種至今已發現的支原體,具有廣譜的識別能力。
如發現細胞被支原體污染,本公司提供細胞支原體清除和預防試劑。
PCR法支原體檢測試劑盒介紹的太全面了,歡迎圍觀!
上一篇 : 氟硅酸現貨供應以及制備方法!
下一篇 : 通道蛋白是什么,信帆生物幫您解答!