免疫沉淀(immunoprecipitation,IP)是利用抗體特異性反應(yīng)純化富集目的蛋白的一種方法。抗體與細胞裂解液或表達上清中相應(yīng)的蛋白結(jié)合后,再與蛋白A/G(ProteinA/G)或二抗偶聯(lián)的agarose或Sepharose珠子孵育,通過離心得到珠子-蛋白A/G或二抗-抗體-目的蛋白復(fù)合物,沉淀經(jīng)過洗滌后,重懸于電泳上樣緩沖液,煮沸5-10min,在高溫及還原劑的作用下,抗原與抗體解離,離心收集上清,上清中包括抗體、目的蛋白和少量的雜蛋白。
傳統(tǒng)的瓊脂糖微球是多孔的,這使得它們具有高的表面積與蛋白質(zhì)相互接觸,并可以容納大量的液體。在純化大量蛋白的時候,傳統(tǒng)的瓊脂糖微球是的選擇。免疫沉淀(IP)-利用結(jié)合在微球上的抗體將溶液中的目標蛋白質(zhì)拉下來。過去,我們很自然地使用瓊脂糖微球,因為這是我們的習(xí)慣。但對IP來說,多孔的結(jié)構(gòu)會帶來如下問題:
1)抗體被困在孔內(nèi),難以洗去,因此需要大量的洗滌來降低背景。
2)免疫沉淀的洗滌是在微量離心管中進行的,液體之間的交換通過移液槍來完成,很容易丟失樣品。
3)微球上的抗體與目標蛋白接觸的慢,需要長的孵育時間。
4)長的孵育時間及大量的洗滌導(dǎo)致目標蛋白的機械及生物(蛋白酶水解)損失。
所有這些變化意味實驗結(jié)果可能并不能如我們所愿進行復(fù)制。
現(xiàn)在,科學(xué)家在IP實驗中,更傾向于使用磁性微球,而不是瓊脂糖微球。因為磁性微球能夠解決上述的所有問題。磁性微球不是多孔的,有磁性,這意味著:
1)沒有使抗體藏在深處的隱藏表面,所需的洗滌次數(shù)減少。
2)微球上的抗體與目標蛋白很快接觸,孵育時間減少。
3)少的洗滌次數(shù)及快的孵育時間意味著目標蛋白被蛋白酶水解的機會減少。
4)磁力架快速分離沉淀和上清液,從而降低了丟失樣品的機會。節(jié)約了操作時間,使操作更自動化。
操作中變量的減少使得實驗很容易再復(fù)制。
比較了磁性微球和傳統(tǒng)瓊脂糖微球在IP中的應(yīng)用,你更傾向于選擇哪種呢?
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