【實驗目的】
1、掌握蛋白質序列檢索的操作方法;
2、熟悉蛋白質基本性質分析;
3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白質功能預測,了解基于motif、 結構位點、結構功能域數據庫的蛋白質功能預測;
4、了解蛋白質結構預測。
【實驗內容】
1、使用Entrez或SRS信息查詢系統(tǒng)檢索人脂聯(lián)素 (ADIponectin)蛋白質序列;
2、使用BioEdit軟件對上述蛋白質序列進行分子質量、氨基酸組成、和疏水性等基本性質分析;
3、對人脂聯(lián)素蛋白質序列進行基于ncbi/Blast軟件的蛋白質同源性分析;
4、對人脂聯(lián)素蛋白質序列進行motif結構分析;
5、對人脂聯(lián)素蛋白質序列進行二級結構和三維結構預測。
【實驗方法】
1、人脂聯(lián)素蛋白質序列的檢索:
(1)調用Internet瀏覽器并在其地址欄輸入Entrez;
(2)在Search后的選擇欄中選擇protein;
(3)在輸入欄輸入homo sapiens adiponectin;
(4)點擊go后顯示序列接受號及序列名稱;
(5)點擊序列接受號NP_004788 (adiponectin precursor; adipose most abundant gene transcript 1
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